Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB3O43889 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB3O43889 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB3O43889 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB3O43889 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB3O43889 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB3O43889 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB3O43889 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB3O43889 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB3O43889 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB3O43889 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB3O43889 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB3O43889 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB3O43889 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB3O43889 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB3O43889 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CREB3O43889 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CREB3O43889 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CREB3O43889 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms