Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HMGB1P1B2RPK0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGB1P1B2RPK0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms