Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
E2F8A0AVK6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
E2F8A0AVK6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms