Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AC025154.2-203ENST00000550214 1031 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Q9Y3F1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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