Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHKBQ9Y259 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms