Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

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Length 633 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CPNE7Q9UBL6 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CPNE7Q9UBL6 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CPNE7Q9UBL6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CPNE7Q9UBL6 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CPNE7Q9UBL6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CPNE7Q9UBL6 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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