Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DNMT3BQ9UBC3 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms