Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RRBP1Q9P2E9 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RRBP1Q9P2E9 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms