Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
SH3BP4Q9P0V3 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms