Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GKN1Q9NS71 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms