Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 KYAT1-201ENST00000302586 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 FDFT1-214ENST00000528812 2013 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PDGFDQ9GZP0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms