Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CD99L2-205ENST00000437787 3493 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 NCOR2-202ENST00000404121 7175 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TRIM4Q9C037 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms