Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC3A1-208ENST00000410056 1426 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRAK4-202ENST00000440781 1409 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01747-203ENST00000634603 1377 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MEG8-220ENST00000636052 1369 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM126B-201ENST00000358867 989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 FCER1A-202ENST00000368115 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 STX1A-202ENST00000395154 1022 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 KRT18P50-201ENST00000404337 1243 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00626-201ENST00000420691 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01888-202ENST00000457602 574 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078788.1-201ENST00000498457 634 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
KRTAP9-3Q9BYQ3 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms