Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
KATNB1Q9BVA0 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms