Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TINF2Q9BSI4 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 MIR4435-2HG-204ENST00000419736 777 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TINF2Q9BSI4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms