Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FYCO1Q9BQS8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FYCO1Q9BQS8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms