Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLF1Q9BQI6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms