Protein–RNA interactions for Protein: Q99538

LGMN, Legumain, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGMNQ99538 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LGMNQ99538 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms