Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SIN3AQ96ST3 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms