Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TMEM168-201ENST00000312814 7470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC97Q96F63 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms