Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SIRT1Q96EB6 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms