Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HPS3Q969F9 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms