Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTC29Q8NA56 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms