Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SYNE4Q8N205 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SYNE4Q8N205 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms