Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
LMNTD2Q8IXW0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms