Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LRIG3Q6UXM1 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRIG3Q6UXM1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms