Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ6

FBXO38, F-box only protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO38Q6PIJ6 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FBXO38Q6PIJ6 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 GNG12-AS1-201ENST00000413628 2058 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FBXO38Q6PIJ6 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms