Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNT1Q5JUK3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms