Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TDRD12Q587J7 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TDRD12Q587J7 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms