Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
KLHL12Q53G59 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
KLHL12Q53G59 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms