Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
SGSM1Q2NKQ1 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SGSM1Q2NKQ1 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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