Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 GLI3-201ENST00000395925 8208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 TMEM131L-202ENST00000409663 5017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 HS3ST1-201ENST00000002596 8031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RRN3P1Q2M238 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms