Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CSPP1Q1MSJ5 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSPP1Q1MSJ5 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms