Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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RTN1Q16799 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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RTN1Q16799 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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RTN1Q16799 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RTN1Q16799 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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