Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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CDKN3Q16667 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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CDKN3Q16667 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CDKN3Q16667 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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