Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ZNF239Q16600 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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