Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
SGCBQ16585 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SGCBQ16585 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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