Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
GABRA6Q16445 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms