Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AFDN-206ENST00000392112 7459 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 USP38-201ENST00000307017 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TCF23-201ENST00000296096 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
TWIST1Q15672 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms