Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TAF1AQ15573 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TAF1AQ15573 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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TAF1AQ15573 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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TAF1AQ15573 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
TAF1AQ15573 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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