Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AP001442.1-203ENST00000596385 876 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SKIV2LQ15477 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 329.1 ms