Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SEC23BQ15437 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms