Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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PTPRKQ15262 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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PTPRKQ15262 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRKQ15262 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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PTPRKQ15262 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRKQ15262 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
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