Protein–RNA interactions for Protein: Q15078

CDK5R1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5R1Q15078 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CDK5R1Q15078 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CDK5R1Q15078 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms