Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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EEA1Q15075 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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EEA1Q15075 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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EEA1Q15075 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
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EEA1Q15075 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EEA1Q15075 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
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