Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 TRBC2-201ENST00000466254 758 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ARHGEF6Q15052 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms