Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KCNAB1Q14722 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms