Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CBFBQ13951 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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CBFBQ13951 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
CBFBQ13951 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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