Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 OR3A1-202ENST00000615105 966 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ATRQ13535 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SOD2-205ENST00000444946 917 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PRKACA-208ENST00000589994 1127 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 Metazoa_SRP.210-201ENST00000637921 244 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 BCCIP-203ENST00000368759 1433 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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