Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MKRN4PQ13434 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ANKRD66-202ENST00000565422 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LYRM4-207ENST00000480566 941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AF186192.2-204ENST00000581667 524 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC009464.1-201ENST00000615731 469 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LINC00333-201ENST00000446314 613 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 LINC00331-201ENST00000446391 376 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MKRN4PQ13434 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
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